Advertisements
Advertisements
Wissenschaften

Weltweit erste Kartierung des australischen Tigergarnelen-Genoms

CC-BY 3.0“>

CC-BY 3.0” width=”800″ height=”512″/>
Die Riesentigergarnele (Penaeus monodon) ist die dominierende Garnelenart, die in Asien und Australien gezüchtet wird. Wissenschaftler von CSIRO Marine Research arbeiten daran, die durchschnittliche Produktionsleistung der Riesentigergarnele zu verbessern, die Kapazität von Garnelenfarmen zu verbessern, um Teiche mit Nachkommen aus domestizierten Brutbeständen zu bestücken, und selektive Züchtung für kommerziell nützliche Merkmale zu entwickeln und einzuführen. Bildnachweis: CSIRO Marine Research/Wikimedia Commons, CC-BY 3.0

Forscher der James Cook University waren Teil der allerersten erfolgreichen Bemühungen, das Genom einer legendären australischen Meeresfrüchteart – der australischen schwarzen Tigergarnele – zu kartieren, was in Zukunft zu größeren und krankheitsresistenteren Zuchtbeständen führen könnte.


JCU-Professor für Aquakultur, Dean Jerry, sagte, die Forschung sei aus dem ARC Industrial Transformation Research Hub for Advanced Breeding hervorgegangen, einer Zusammenarbeit zwischen der JCU, der Australian Genome Research Facility (AGRF), der University of Sydney, CSIRO und der Seafarms Group. Die Partnerschaft zielte darauf ab, die Produktivität und Effizienz der Garnelenzucht durch den Einsatz genetischer Selektion zu verbessern.

„Die Idee war, die Fähigkeit australischer Garnelenzüchter zu verbessern, selektive Zuchtpraktiken anzuwenden, um größere und gesündere Zuchtgarnelen zu produzieren. Als Teil dieses Projekts machten wir uns daran, das Genom der schwarzen Tigergarnele zu sequenzieren. Die Informationen im Genom sind wichtig für uns zu wissen, da es im Wesentlichen den Bauplan enthält, der die Zusammensetzung und das Verhalten der Garnele bestimmt”, sagte Professor Jerry.

Er sagte, ein Vorteil dieses Genoms sei, dass es bei den selektiven Zuchtbemühungen von Garnelen erheblich helfen könne, ähnlich wie es in den letzten paar tausend Jahren mit Vieh- und Nutzpflanzenarten passiert sei.

“Die Garnele ist ein winziges Tier, aber ihr Genom ist fast so groß wie das eines Menschen und viel komplizierter in seiner Struktur”, sagte Professor Jerry.

AGRF-Bioinformatik-Manager Dr. Kenneth Chan sagte, der genetische Kartierungsprozess zur Rekonstruktion des Genoms der schwarzen Tigergarnele sei teuflisch knifflig.

„Stellen Sie sich die Aufgabe vor, ein doppelseitiges Puzzle mit 1,9 Milliarden Teilen ohne Ränder, lange, sich wiederholende überlappende Abschnitte, Millionen fehlender Teile, mehrere Teile, die an die gleiche Stelle passen, kein Bild auf der Schachtel, das folgt, und möglicherweise viele Teile zusammenzusetzen aus Teilen eines anderen Puzzles ohne Bezug”, sagte Dr. Chan.

Die Wissenschaftler fanden auch etwas sehr Ungewöhnliches in der Art und Weise, wie die Tigergarnele virale Infektionen bekämpft.

Dr. Nick Wade, leitender Forschungswissenschaftler bei CSIRO, erklärte, dass die viralen Elemente im Genom, die bei der Bekämpfung von Virusinfektionen helfen (bekannt als das endogene virale Element oder EVE), in der australischen Tigergarnele wirklich einzigartig sind.

„Kein EVE, das in irgendeinem anderen Tier gefunden wurde, sieht so aus“, sagte Dr. Wade.

„Die Entdeckung dieses EVE ermöglicht weitere Forschungen zum Verständnis, wie Garnelen mit Infektionen durch Viren umgehen, und möglicherweise zu neuen Therapien, die angewendet werden können, um Garnelen widerstandsfähiger gegen Viruserkrankungen zu machen“, sagte er.

Professor Jerry sagte, dass die Vorteile der Kartierung des Genoms in einer ganzen Reihe von komplementären Bereichen liegen werden.

“Es verändert die Landschaft für die Garnelenforschung radikal und ermöglicht eine ganze Reihe anderer funktioneller biologischer Studien, einschließlich der Frage, wie man bestimmte Gene für verbesserte Selektionsergebnisse ansteuern kann, bis hin zur präzisen Gentechnik”, sagte Professor Jerry.


Krabben-Spawn-Geheimnisse in 3D-Bildern entschlüsselt


Mehr Informationen:
Roger Huerlimann et al., Genomassemblierung der australischen schwarzen Tigergarnele (Penaeus monodon) enthüllt eine neuartige fragmentierte IHHNV-EVE-Sequenz, G3 Gene|Genome|Genetik (2022). DOI: 10.1093/g3journal/jkac034

Bereitgestellt von der James Cook University

Zitat: Weltweit erste Kartierung des australischen Tigergarnelengenoms (2022, 14. März), abgerufen am 14. März 2022 von https://phys.org/news/2022-03-world-first-aussie-tiger-prawn-genome.html

Dieses Dokument ist urheberrechtlich geschützt. Abgesehen von einem fairen Handel zum Zwecke des privaten Studiums oder der Forschung darf kein Teil ohne schriftliche Genehmigung reproduziert werden. Der Inhalt dient nur zu Informationszwecken.


💙 Intern: Weil wir unabhängig sind, sowie keinen "unendlichen" Gewinn anstreben, geben wir in jedem Monat ungefähr ein drittel, aller Einnahmen aus Werbung und Spenden an die Katastrophenschutzhilfe. 
Wir freuen uns auch über jede kleine Spende z.B. über PayPal.

Ähnliche Artikel.

Astronomisches Bild des Tages

NGC 1316: Nachdem Galaxien kollidieren Bildnachweis und Urheberrecht: Erfassung: Greg Turgeon; Wird bearbeitet: Kiko Fairbairn Erläuterung: Astronomen werden zu Detektiven, wenn sie versuchen, die…

Tiefseeerwärmung im Zuge des Klimawandels

Der subtropische Nordatlantik. Bildnachweis: Marie-Jose Messias Ein Großteil der im subtropischen Nordatlantik gespeicherten „überschüssigen Wärme“ befindet sich in der Tiefsee (unter 700 m), wie neue…

1 of 119